עקרון העבודה של המסנן מתמצה כדלקמן:
בתקופת הסרק של המסנן, חול הקוורץ נשאר במצב דחוס בהשפעת כוח המשיכה שלו. בתחילת הפעולה, מים גולמיים נכנסים תחילה דרך שסתום הכניסה לערוץ ההפצה; לאחר מכן הוא נשפך למטה דרך שוקת החלוקה, עובר דרך חול הקוורץ לצורך סינון, ולבסוף מופנה דרך צינור המים המסונן בתחתית המסנן אל מאגר המים הצלולים. ככל שזמן הפעולה מתארך, חול הקוורץ צובר כמות הולכת וגדלה של זיהומים, ההתנגדות של מצע המסנן עולה בהתמדה, ומפלס המים בתוך המסנן עולה בהדרגה. ברגע שמפלס המים מגיע לגובה מסוים, יעילות הסינון של היחידה יורדת באופן משמעותי; בשלב זה, המסנן דורש שטיפה לאחור. במהלך שטיפה לאחור, משאבת השטיפה לאחור ושסתום מי השטיפה האחורית הממוקם בתחתית המסנן מופעלות, מה שגורם למי שטיפה לאחור לזרום כלפי מעלה בכיוון- נגד זרם. לאחר שחול הקוורץ התרחב במלואו, מפוח האוויר מופעל; לאחר שהמפוח מתייצב, שסתום כניסת האוויר ושסתום פריקת מי השטיפה נפתחים כדי לבצע שטיפת אוויר-ו-משולבת של מדיית המסנן. לאחר 5 עד 8 דקות, שסתום כניסת האוויר והמפוח נסגרים, ואמצעי המסנן עוברים שטיפת מים- בלבד. לאחר עוד 2 עד 4 דקות, תהליך הכביסה מסתיים; משאבת השטיפה לאחור ושסתום מי השטיפה לאחור סגורים, ושסתום כניסת המים הגולמיים נפתח לביצוע שטיפה משטחית. לאחר 1 עד 4 דקות, שטיפת פני השטח הושלמה; שסתום פריקת מי השטיפה לאחור נסגר, שסתום יציאת המים המסוננים נפתח, ויחידת המסנן נכנסת למחזור הפעולה הבא.
במהלך שטיפה לאחור, מדיית מסנן חול הקוורץ נשארת במצב מורחב בהשפעה משולבת של כוח הכבידה וזרימת המים. המים הבוציים שנעקרו במהלך השטיפה לאחור זורמים אל שוקת הניקוז (המשמשת שוקת החלוקה בשלב הסינון) ונפלטים לאחר מכן דרך שסתום הזרמת מי השטיפה. עם השלמת השטיפה לאחור, חומר מסנן חול הקוורץ מתיישב ו-מתכווץ מחדש תחת כוח הכבידה, ויוצר מצע מסנן עם שיפוע צפיפות-דל למעלה ודחוס יותר בתחתית-מה שמסייע מאוד ללכידה יעילה של זיהומים.
עיצוב פרמטרים של שטיפה לאחור עבור פרויקט זה:
שטיפת אוויר-ו-משולבת מים: שטף אוויר: 55 m³/m²/h; שטף מים: 10 m³/m²/h.
מים-שטיפה לאחור בלבד: 17 מ"ר/מ"ר לשעה.
